أسفرت قرعة بطولة الكونفيدرالية الأفريقية موسم 2024-2025، عن وجود الزمالك في المجموعة الرابعة، إلى جانب أندية المصري البورسعيدي، إنييمبا النيجيري، وبلاكبولز الموزمبيقي. وتعتبر هذه المرة الرابعة التي يشارك فيها الزمالك في بطولة الكونفيدرالية، حيث كانت مشاركته الأولى في موسم 2017-2018، وحقق اللقب في النسخة التالية. تبدأ مرحلة المجموعات من الكونفيدرالية الإفريقية لموسم 2024-2025 في 28 نوفمبر 2024، على أن تُختتم مباريات هذه المرحلة في منتصف يناير 2025.
جدول مباريات الزمالك في الكونفيدرالية الإفريقية 2024-2025:
الزمالك ضد بلاك بولز (28 نوفمبر 2024)
إنييمبا ضد الزمالك (8 ديسمبر 2024)
الزمالك ضد المصري (15 ديسمبر 2024)
المصري ضد الزمالك (5 يناير 2025)
بلاك بولز ضد الزمالك (12 يناير 2025)
الزمالك ضد إنييمبا (19 يناير 2025)